El CEJU, como institución de educación superior del IMPIP, se encuentra afiliada a la Alianza para la Educación Superior (ALPES); al Consejo Nacional de Instituciones de Enseñanza Criminológica (CIECRIM); a la Asociación Nacional de Facultades, Escuelas, Departamentos de Derecho e Institutos de Investigación Jurídica (ANFADE); a la Asociación de Facultades, Escuelas e Institutos de Derecho de América Latina (AFEIDAL); entre otras.
De igual manera, cuenta con la Norma ISO 9001 - 2008, que lo acredita como institución que presta servicios de alta calidad, la cual se llevó a cabo por el IQS Corporation, Organismo Internacional de Certificación de Sistemas de Gestión.
